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2025-03-04

论文解读Vol.1 | 生物学大模型ESM3登Science封面，可推理蛋白质序列、结构和功能

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《Science》封面

近日，由前 Meta 首席科学家 Alexander Rives 领衔的初创公司 EvolutionaryScale，推出一款多模态生成语言模型——ESM3，可以推理蛋白质的序列、结构和功能。

该模型不仅能够生成功能性蛋白质，还能够模拟超过 5 亿年的进化过程，生成与自然界已知蛋白序列不同的全新蛋白质。

研究人员使用 ESM3 设计了一种名为 esmGFP 的新荧光蛋白，它与已知最相似的荧光蛋白序列同源性仅为 58%，这在以往的人工设计中是极为罕见的。

相关研究以《Simulating 500 million years of evolution with a language model》为题，发布在《Science》上，并登上 《Science》封面。

开源地址：https://github.com/evolutionaryscale/esm

论文链接：https://www.scnet.cn/ui/mall/search/goods?keyword=ESM3

蛋白质是生物体中重要的功能性分子，其形成过程历经数十亿年的自然选择和进化。

当前，科学家已经开发和评估了许多蛋白质序列的语言模型。研究发现，语言模型中出现的表征反映了蛋白质的生物结构和功能，并且无需任何监督即可学习这些属性，并随着规模的扩大而不断改进。

在此，研究人员提出了一种前沿的多模态生成语言模型 ESM3，使得可编程蛋白质设计成为可能。

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