Gaussian

Gaussian是做半经验计算和从头计算使用最广泛的量子化学软件，可以研究:分子能量和结构，过渡态的能量和结构，化学键以及反应能量，分子轨道，偶极矩和多极矩，原子电荷和电势，振动频率，红外和拉曼光谱，NMR，极化率和超极化率，热力学性质，反应路径。 支持模板提交和命令行提交两种作业运行方式，具体方法如下：

注意事项：Gaussian为商业软件，请在商城中搜索该商品并购买授权使用。

模板提交

1. 您可以通过如下几个入口模板提交作业

   1）进入控制台，点击作业提交，选择Gaussian软件

   

   2）或者通过我的商品-应用软件菜单入口，选择Gaussian软件

   

2. 选择已开通区域对应的资源，填写相应的配置信息后，提交模版作业

   1）选择合适的计算资源后，再通过本地上传或者文件选择器选择文件，此处填写参数需要注意以下几点：

    a.作业名称一般为默认，可按需求修改；
    b.版本为安装软件的可执行程序路径
    c.核心/节点为每节点核数，与节点数相乘即为作业使用总核数；
    d.作业时限为作业运行最大时长，作业超时即自动退出；
    e.工作目录默认为输入文件所在目录；
   

   2）点击提交作业

3. 提交作业，查看作业详情

   1）模版提交作业后可查看运行的作业详情

   2）也可以通过作业管理入口，查看当前作业和历史作业

   3）点击作业ID，查看具体的作业详情

命令行提交

1. 您可以通过如下几个入口进入命令行运行作业

   1）进入控制台，点击作业提交，选择Gaussian软件

2）或者通过我的商品-应用软件菜单入口，选择Gaussian软件

2. 切到用户家目录下，编写g09.slurm文件
   

   如下是一个参考文件

#!/bin/bash
#SBATCH -J g09 #任务名称
#SBATCH -N 1 #节点数
#SBATCH --ntasks-per-node=64 #核心数
#SBATCH -p xhacnormalb

INPUT_FILE=test.gjf
source ../scripts/env.sh
export PGI_FASTMATH_CPU=sandybridge
sed -i  "/nprocshared=/c%nprocshared=${SLURM_NTASKS}" $INPUT_FILE #替换申请核心数
sed -i  "/nproc=/c%nproc=${SLURM_NTASKS}" $INPUT_FILE

g09 < $INPUT_FILE

3. 通过sbatch命令提交作业

4. 通过squeue 命令查看作业运行情况 squeue

查看作业运行情况及参数详细介绍请点击查看SLURM命令。

结果文件下载请查看数据传输。