VASP

VASP是维也纳大学Hafner小组开发的进行电子结构计算和量子力学-分子动力学模拟软件包。它是目前材料模拟和计算物质科学研究中最流行的商用软件之一。 支持模版提交和命令行提交两种作业运行方式，具体方法如下：

注意事项： VASP 为商业软件，为商业软件，请在商城中搜索该商品并购买授权使用。

模板提交

1. 您可以通过如下几个入口模板提交作业

   1）进入控制台，点击作业提交，选择VASP软件

   2）或者通过我的商品-应用软件菜单入口，选择VASP软件

   

2. 选择已开通区域对应的资源，填写相应的配置信息后，提交模版作业
   【注意】根据任务申请的核数分配内存，核心/节点表示单节点使用的核数，最多不超过单节点总核数，可以点击队列下方的详情查看单节点配置的总核数。

   1）选择合适的计算资源后，再通过本地上传或者文件选择器选择文件，此处填写参数需要注意以下几点：

    a.作业名称一般为默认，可按需求修改；
    b.版本为安装软件的可执行程序路径；
    c.核心/节点为每节点核数，与节点数相乘即为作业使用总核数；
    d.作业时限为作业运行最大时长，作业超时即自动退出（即将超时但还在运行中的任务可以进行延时操作：在作业管理找到对应的作业号，点击作业号，在运行时限处点击延长来延长任务运行时间）；
    e.工作目录默认为输入文件所在目录；
   

   2）点击提交作业

3. 提交作业，查看作业详情

   1）模版提交作业后可查看运行的作业详情

   2）也可以通过作业管理入口，查看当前作业和历史作业

   3）点击作业ID，查看具体的作业详情

命令行提交

1. 您可以通过如下几个入口进入命令行运行作业

   1）进入控制台，点击作业提交，选择VASP软件

   2）或者通过我的商品-应用软件菜单入口，选择VASP软件

2. 切到用户家目录下，编写job_VASP.slurm文件
   

   如下是一个参考文件

      #!/bin/bash 
      #SBATCH -J VASP_1118_113736 #作业名称
      #SBATCH -p kshcnormal #队列名称
      #SBATCH -N 1 #节点数量
      #SBATCH --ntasks-per-node=32 #每节点核心数
      #SBATCH --time 72:00:00
      #SBATCH --comment=VASP
      #SBATCH -o std.out.%j
      #SBATCH -e std.err.%j
   
      ### Run VASP
      cd $WORK_DIR
      #module load compiler/intel/intel-compiler-2017.5.239
      #module load mpi/intelmpi/2017.4.239
      module purge
   
      echo $MODULE_ENV > $MIDFILE_DIR/app.env
      sed -i 's/_USER_COLON_SIGN_IN_GV_/:/g' $MIDFILE_DIR/app.env
      source $MIDFILE_DIR/app.env
   
      mpirun -np "$SLURM_NPROCS" $APP/$GROP_APP 2>&1 | tee -a $LOG_FILE
   
      echo The end time is: `date +"%Y-%m-%d %H:%M:%S"` | tee -a $LOG_FILE

3. 通过sbatch命令提交作业

4. 通过squeue 命令查看作业运行情况 squeue

查看作业运行情况及参数详细介绍请点击查看SLURM命令。

结果文件下载请查看数据传输。